岩月さんの日記を参考に、dot のかわりに neato で描くようにしてみました (例:書体関係 Wiki)。
ただ、場合によっては、dot だろうと neato だろうと Segmentation Fault で落ちているみたい。
[追記] neato だと、ページ数が多い Hiki では重なりが激しすぎてちょっと使いものにならないのでやめました。neato のほうが Segmentation Fault 率が高かったみたいだし。
debian では non-free と書きましたが、2004 年 12 月 11 日に CPL になったそうです。日付から判断すると、バージョン 1.18 以降になるのかな。
As of 11 December 2004, Graphviz is licensed by AT&T under the Common Public License (CPL). This license is endorsed by the Open Source Initiative.